remove executable permissions on non-executables and non-scripts

src/KOKKOS/compute_temp_kokkos.h

src/KOKKOS/dihedral_charmm_kokkos.cpp

src/KOKKOS/dihedral_charmm_kokkos.h

src/KOKKOS/dihedral_opls_kokkos.cpp

src/KOKKOS/dihedral_opls_kokkos.h

src/KOKKOS/fix_deform_kokkos.cpp

src/KOKKOS/fix_deform_kokkos.h

src/KOKKOS/fix_nh_kokkos.cpp

src/KOKKOS/fix_nh_kokkos.h

src/KOKKOS/fix_nph_kokkos.cpp

src/KOKKOS/fix_nph_kokkos.h

src/KOKKOS/fix_npt_kokkos.cpp

src/KOKKOS/fix_npt_kokkos.h

src/KOKKOS/fix_nvt_kokkos.cpp

src/KOKKOS/fix_nvt_kokkos.h

src/KOKKOS/fix_setforce_kokkos.cpp

src/KOKKOS/fix_setforce_kokkos.h

src/KOKKOS/fix_wall_reflect_kokkos.cpp

src/KOKKOS/fix_wall_reflect_kokkos.h

src/KOKKOS/improper_harmonic_kokkos.cpp