src/extraction/core/functions · be41600875889fa7cf712e703a78e238a383e1fb · Swain Lab / aliby / alibylite

Forked from Swain Lab / aliby / aliby-mirror

Source project has a limited visibility.

authored

Name	Last commit	Last update
..
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/ASPHERE
src/BODY
src/CLASS2
src/COLLOID
src/COMPRESS
src/CORESHELL
src/DEPEND
src/DIPOLE
src/GPU
src/GRANULAR
src/KIM
src/KOKKOS
src/KSPACE
src/LATTE
src/MAKE
src/MANYBODY
src/MC
src/MEAM
src/MISC
src/MOLECULE
src/MPIIO
src/MSCG
src/OPT
src/PERI
src/POEMS
src/PYTHON
src/QEQ
src/REAX
src/REPLICA
src/RIGID
src/SHOCK
src/SNAP
src/SRD
src/STUBS
src/USER-ATC
src/USER-AWPMD
src/USER-BOCS
src/USER-CGDNA
src/USER-CGSDK
src/USER-COLVARS
src/USER-DIFFRACTION
src/USER-DPD
src/USER-DRUDE
src/USER-EFF
src/USER-FEP
src/USER-H5MD
src/USER-INTEL
src/USER-LB
src/USER-MANIFOLD
src/USER-MEAMC
src/USER-MESO
src/USER-MGPT
src/USER-MISC
src/USER-MOFFF
src/USER-MOLFILE
src/USER-NETCDF
src/USER-OMP
src/USER-PHONON
src/USER-QMMM
src/USER-QTB
src/USER-QUIP
src/USER-REAXC
src/USER-SMD
src/USER-SMTBQ
src/USER-SPH
src/USER-TALLY
src/USER-UEF
src/USER-VTK
src/VORONOI
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h
src/.gitignore
src/Depend.sh
src/Install.sh
src/Make.sh
src/Makefile
src/Makefile.list
src/Makefile.package.empty
src/Makefile.package.settings.empty
src/Package.sh
src/Purge.list
src/accelerator_kokkos.h
src/accelerator_omp.h
src/angle.cpp
src/angle.h
src/angle_hybrid.cpp
src/angle_hybrid.h
src/angle_zero.cpp
src/angle_zero.h
src/atom.cpp
src/atom.h
src/atom_map.cpp
src/atom_map.h
src/atom_masks.h
src/atom_vec.cpp
src/atom_vec.h
src/atom_vec_atomic.cpp
src/atom_vec_atomic.h
src/atom_vec_body.cpp
src/atom_vec_body.h
src/atom_vec_charge.cpp
src/atom_vec_charge.h